近年來(lái),基于CRISPR/Cas9的基因組編輯技術(shù)具有簡(jiǎn)單,高效的特點(diǎn),在生命科學(xué)領(lǐng)域得到廣泛的應(yīng)用。CRISPR/Cas9 基因編輯系統(tǒng)可以對(duì)靶位點(diǎn)DNA進(jìn)行切割從而形成DNA雙鏈斷裂,引起DNA的非同源末端連接(nonhomologous end joining, NHEJ) 或者提供供體DNA片段引起同源重組修復(fù)(homologous recombination,HDR)。同源重組修復(fù)效率低下。而NHEJ主要是在靶位點(diǎn)附近形成Indel,這種修復(fù)方式往往不可控,不能滿足科研工作者精確定向編輯的要求。
10月25日,哈佛大學(xué)化學(xué)與化學(xué)生物學(xué)系、HHMI以及哈佛-麻省理工大學(xué)Broad研究所的David Liu教授團(tuán)隊(duì)在Nature上發(fā)表了題目為“Programmable base editing of A•T to G•C in genomic DNA without DNA ”的突破性研究成果。該研究報(bào)道了一種腺嘌呤編輯器 (ABE),其核心是發(fā)現(xiàn)了一種腺嘌呤脫氨酶(ecTadA),ecTadA可以對(duì)腺嘌呤(A)進(jìn)行脫氨形成肌苷(I),而肌苷在DNA復(fù)制中被DNA聚合酶識(shí)別為鳥嘌呤(G),從而通過(guò)DNA的復(fù)制就可以把基因組DNA的A•T堿基對(duì)轉(zhuǎn)換成G•C堿基對(duì)。在這項(xiàng)研究中,David Liu實(shí)驗(yàn)室的研究人員通過(guò)對(duì)TadA進(jìn)行優(yōu)化,獲得了多種修飾的TadA*,并且與dCas9融合(TadA*-dCas9),形成多種腺嘌呤編輯器(ABEs),通過(guò)效率與準(zhǔn)確率的篩選分析,獲得的ABE7.10的定向編輯效率約為50%。
結(jié)合本次研究成果,目前單堿基基因編輯技術(shù)實(shí)現(xiàn)了不依賴于DNA斷裂而能夠?qū)?/span>DNA四種堿基A、T、G、C進(jìn)行替換的編輯技術(shù)。目前單堿基編輯系統(tǒng)變得越來(lái)越精確,越來(lái)越完善,必將極大的推動(dòng)人類疾病的臨床治療和動(dòng)植物的育種進(jìn)程。
參考文獻(xiàn):
1. Nicole M. Gaudelli, Alexis C. Komor, Holly A. Rees, Michael S. Packer, Ahmed H. Badran, David I. Bryson & David R. Liu. Programmable base editing of A•T to G•C in genomic DNA without DNA cleavage. Nature (2017) Published online 25 October 2017.
2. Komor, A.C., Kim, Y.B., Packer, M.S., Zuris, J.A. & Liu, D.R. Programmable editing of a target base in genomic DNA without double-stranded DNA cleavage. Nature 533, 420-424 (2016).